SystemError: initialization of _internal failed without raising an exception
問題の概要
Python環境でTop2Vec
などの特定のパッケージをインポートしようとすると、次のエラーが発生する場合があります:
SystemError: initialization of _internal failed without raising an exception
このエラーは主に以下の状況で発生します:
Top2Vec
などのNLP関連パッケージのインポート時numba
やnumpy
の互換性問題が背景にある場合が多い- パッケージの依存関係に不整合がある環境
- 特定のPythonバージョンとの非互換性
ユーザーはpip install --upgrade pip
やpip install --upgrade numpy
を試みても解決しないと報告しています。
解決方法
以下の解決策を順番に試してください。多くの場合、最初の2つの方法で問題が解決します。
1. カーネル/インタプリタの再起動 (最も簡単な解決策)
最初に試すべき簡易解決法
単純な環境リセットで解決する場合があります:python
# Jupyter Notebook/Labの場合:
Kernel → Restart Kernel
# VS Code/PyCharmなど:
インタプリタを完全に再起動
理由: キャッシュされた古いモジュールが原因である可能性 適用ケース: AWS Linux環境などで既存バージョン使用時
2. numba
のアップグレード (最も一般的な解決策)
ターミナルで実行:
bash
pip install -U numba
この後にプログラムを再実行:
python
from top2vec import Top2Vec # 正常にインポートできることを確認
頻出ケース:
umap
やscikit-image
などのパッケージと競合- 特定バージョンで発生する内部エラー
- 解決しない場合は完全な再インストールを試す:
bash
pip uninstall numba
pip install numba
3. numpy
のバージョンを1.23.5に固定
問題が特定のnumpy
バージョンで発生する場合:
bash
pip install numpy==1.23.5
適用条件:
numpy 1.24.0
以上を使用している場合- 他の数値計算ライブラリとの依存関係が崩れている場合
4. Pythonバージョンのアップグレード (根本的解決)
Python 3.9以下を使用している場合:
bash
# pyenvを使用する例
pyenv install 3.10.6
pyenv global 3.10.6
# 環境再作成 (venv/anaconda)
python -m venv new_env
source new_env/bin/activate
pip install top2vec
注意: 必ず仮想環境内で実施
予防策とベストプラクティス
依存関係の明示化
bashpip freeze > requirements.txt # 環境保存 pip install -r requirements.txt # 環境復元
仮想環境の活用
bashpython -m venv top2vec_env source top2vec_env/bin/activate
バージョン互換性の確認
pythonimport numba, numpy print(numba.__version__) # 0.56.4以降が望ましい print(numpy.__version__) # 1.23.5が安定版
段階的インストール
bashpip install numpy==1.23.5 pip install numba==0.56.4 pip install top2vec
根本原因
このエラーは主に以下の組み合わせで発生します:
numba
の内部キャッシュ機構の不具合numpy
の特定バージョンとの非互換性- Python 3.9以下の古いランタイム
- パッケージ間の暗黙的依存関係の競合
上記の解決策で問題が解決しない場合は、Top2Vec公式GitHub Issuesで環境詳細を報告してください。